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唐超副研究员,研究方向:熟悉和掌握高通量测序数据、大规模基因-临床数据分析,包括:R语言和Bioconductor编程和应用、Linux编程、ChIP-Seq、转录组、单细胞转录组、基因突变分析等。主要的工作包括大规模基因数据和临床表现挖掘、二代测序技术对癌症相关基因进行高通量靶向检测panel开发应用、遗传病相关基因检测panel的研发和应用、ctDNA甲基化检测技术开发以及生物信息学新的算法、...
张华华,女,1977年11月生,博士,副教授,硕士研究生导师,长期从事细胞生物学和遗传学的教学与科研工作,研究方向为细胞工程。
作为中心法则的初始一环,DNA复制是最基本最重要的细胞生物过程之一。DNA复制紊乱所产生的缺陷会导致细胞基因组不稳定性,威胁生物个体的生长、发育甚至正常存活(O’Donnell et al., 2013)。关于真核生物的DNA复制分子机制的研究不仅有助于理解这个最重要的生物过程,而且能为复制缺陷导致的衰老以及癌症等疾病的分子病理研究提供理论指导,及其诊断和治疗提供新方案。目前关于真核生物DNA复制...
近日,川北医学院附属医院骨外科、生物组织工程与数字医学研究室科研团队于国际知名学术期刊Nano Today上发表题为《Mito-battery: Micro-nanohydrogel microspheres for targeted regulation of cellular mitochondrial respiratory chain》的科研论文,成果第一单位为川北医学院附属医院,通讯作者...
核苷酸切除修复(Nucleotide Excision Repair, NER)是DNA损伤修复重要组成,包含全基因组核苷酸切除修复和转录偶联核苷酸切除修复两个亚通路。NER是细胞为避免基因组受损和突变而高频率发生的一种应对机制。果蝇研究的优势是可以利用X射线、紫外辐射和化学诱变剂获得大量突变体。然而,对于这些DNA损伤物修复机制的研究还有很多未知,特别是对果蝇核苷酸切除修复方式一直存在误解:人们...
线粒体既是细胞的能量工厂,又参与调节细胞的氧化还原和稳态维持。与此相应,线粒体的代谢适能(metabolic fitness)或功能失衡(mitochondrial dysfunction)与机体和组织的健康或多种疾病和衰老的发生有着直接和密切的关联。其中,线粒体中三羧酸循环、电子呼吸链等所参与的氧化代谢及其调控是其功能态的核心环节。然而,由于氧化代谢的水平和氧化还原状态各异,氧化代谢的提升还可能...
细长聚球藻(Synechococcus elongatus),原名Anacystis nidulans,是蓝藻的代表种。它也是研究光修复的模式生物,即使在接受高紫外线剂量后也可以完全光修复。然而,长期以来,在细长聚球藻中只发现了一种光修复酶,它只能光修复紫外线诱导的 DNA 中的环丁烷嘧啶二聚体 (CPD)。
2021年2月12日上海交通大学医学院余健秀研究组在Nucleic Acids Research杂志上在线发表“SUMOylation of YTHDF2 promotes mRNA degradation and cancer progression by increasing its binding affinity with m6A-modified mRNAs”论文(全文链接:https/...
2021年2月2日,清华大学医学院李海涛课题组携手普林斯顿大学Tom Muir课题组和西奈山医学院Ian Maze课题组于《美国科学院院刊》(PNAS)在线发表题为“Histone H3Q5 serotonylation stabilizes H3K4 methylation and potentiates its readout”(组蛋白H3Q5五羟色胺化修饰稳定H3K4甲基化修饰并强化其识别)...
组蛋白修饰携带着关键表观遗传信息,该信息的解码过程往往依赖于“阅读器”(reader)蛋白对修饰的正确解读。组蛋白苯甲酰化修饰(Kbz)是新近鉴定的一类赖氨酸酰基化修饰类型,其广泛分布于组蛋白的柔性尾巴并调控基因转录1。
在基因的表观遗传调控中,不同位点不同类型的组蛋白修饰通常代表了不同的基因调控事件。比如,组蛋白修饰H3K4me3常与基因的活跃转录相关,而组蛋白修饰H3K9me3和H3K27me3则常与基因沉默相关。虽然两类组蛋白修饰的基因组分布很不相同,但在特定基因表达状态切换的特殊时期两种修饰存在基因组上的共定位。
高等生物能够在环境因素刺激下,快速诱导特定基因的表达,保证了炎症反应、热休克应激等诸多细胞过程的发生。以组蛋白修饰和DNA甲基化为代表的表观机制是真核生物进化出来的重要转录调控策略。那么在刺激诱导型转录过程中,是否存在标志性表观修饰参与其中并发挥着关键调控作用呢?
2020年7月23日,《自然》杂志正式发表医学院李海涛课题组和耶鲁大学萧琢(Andrew Z. Xiao)实验室题为“N6-methyladenine in DNA antagonizes SATB1 in early development”(DNA N6-甲基腺嘌呤(6mA)在早期发育过程中拮抗SATB1)的合作文章。该论文发现DNA 6mA修饰可以拮抗基因组组织蛋白SATB1在SIDD(压力...
赵博,博士,中山大学医学院教授,博士生导师。学科专业:蛋白质生物化学、结构学、分子生物学、免疫学。研究方向:TGF-β家族生长因子的激活与胞外调控机制;新型治疗性抗体研发。
段方方,现任中山大学医学院副教授,硕士研究生导师。2011年本科毕业于山东师范大学生命科学学院生物科学专业,2011-2016年在复旦大学基础医学院攻读博士学位,研究蛋白质翻译后修饰对肿瘤进程影响。2016-2019年于美国芝加哥大学病理系从事与肺纤维化及肿瘤微环境相关的博士后研究工作。期间以第一作者身份在 Journal of hepatology,American Journal of Res...

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